MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Anaplasma marginale str. Florida

Total Repeats: 3657

< Previous12345678Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_012026	GC	3	6	1180683	1180688	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3502	NC_012026	GGCA	2	8	1180762	1180769	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3503	NC_012026	TGT	3	9	1180778	1180786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_012026	GCG	2	6	1180798	1180803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3505	NC_012026	ACC	2	6	1182244	1182249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3506	NC_012026	TG	3	6	1182317	1182322	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_012026	CTC	2	6	1183603	1183608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3508	NC_012026	CG	3	6	1183703	1183708	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3509	NC_012026	CCA	2	6	1183730	1183735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3510	NC_012026	GCA	2	6	1183758	1183763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3511	NC_012026	ATCC	2	8	1183783	1183790	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3512	NC_012026	AGC	2	6	1183814	1183819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3513	NC_012026	CAAC	2	8	1183843	1183850	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3514	NC_012026	ATG	2	6	1183920	1183925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_012026	AAC	2	6	1183967	1183972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3516	NC_012026	ATC	2	6	1183982	1183987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3517	NC_012026	AGT	2	6	1184000	1184005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_012026	TAG	2	6	1184008	1184013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_012026	TAG	2	6	1184020	1184025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_012026	CAG	2	6	1184029	1184034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3521	NC_012026	GGA	2	6	1184044	1184049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_012026	CAAC	2	8	1184094	1184101	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3523	NC_012026	CCT	2	6	1184117	1184122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3524	NC_012026	TGA	2	6	1184170	1184175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_012026	GTG	2	6	1184251	1184256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_012026	TACC	2	8	1184304	1184311	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3527	NC_012026	GCACCA	2	12	1184316	1184327	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3528	NC_012026	ACC	2	6	1184458	1184463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3529	NC_012026	TGT	2	6	1184467	1184472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_012026	CAC	2	6	1184497	1184502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3531	NC_012026	TAC	2	6	1184526	1184531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3532	NC_012026	ACA	2	6	1184563	1184568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3533	NC_012026	AG	3	6	1184604	1184609	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_012026	AAG	2	6	1184667	1184672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_012026	TTA	2	6	1184700	1184705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_012026	AAG	2	6	1184790	1184795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_012026	CTA	2	6	1184818	1184823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3538	NC_012026	TG	3	6	1184846	1184851	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_012026	GCA	2	6	1184872	1184877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3540	NC_012026	CAA	2	6	1184882	1184887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3541	NC_012026	ACC	2	6	1184895	1184900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3542	NC_012026	CCA	3	9	1184911	1184919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3543	NC_012026	GCA	2	6	1184946	1184951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3544	NC_012026	CTA	2	6	1184962	1184967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3545	NC_012026	AGT	2	6	1184982	1184987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_012026	AGG	2	6	1185046	1185051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_012026	CCA	2	6	1185158	1185163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3548	NC_012026	ACC	2	6	1185181	1185186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3549	NC_012026	CA	3	6	1185233	1185238	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3550	NC_012026	CTT	2	6	1185303	1185308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3551	NC_012026	GGA	2	6	1185359	1185364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_012026	TAC	2	6	1185398	1185403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3553	NC_012026	GCT	2	6	1185420	1185425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3554	NC_012026	AG	3	6	1185441	1185446	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_012026	TGG	2	6	1185453	1185458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_012026	CA	3	6	1185515	1185520	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3557	NC_012026	GGT	2	6	1185565	1185570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_012026	GTG	2	6	1185618	1185623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_012026	TGT	2	6	1185632	1185637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_012026	TCA	2	6	1185684	1185689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3561	NC_012026	TTA	2	6	1185699	1185704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_012026	TCT	2	6	1185727	1185732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3563	NC_012026	CAG	2	6	1185733	1185738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3564	NC_012026	AATT	2	8	1185740	1185747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_012026	GCA	2	6	1185753	1185758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3566	NC_012026	CT	3	6	1185763	1185768	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3567	NC_012026	AAT	2	6	1185790	1185795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_012026	TGC	2	6	1185839	1185844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3569	NC_012026	CTT	2	6	1185851	1185856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3570	NC_012026	T	6	6	1185953	1185958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_012026	CCA	2	6	1186006	1186011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3572	NC_012026	CAGC	2	8	1186060	1186067	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3573	NC_012026	CTT	2	6	1186103	1186108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3574	NC_012026	TCTA	2	8	1186127	1186134	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3575	NC_012026	CTTA	2	8	1186136	1186143	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3576	NC_012026	CT	3	6	1186161	1186166	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3577	NC_012026	GCT	2	6	1186276	1186281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3578	NC_012026	CTTC	2	8	1186330	1186337	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3579	NC_012026	GCT	2	6	1186350	1186355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3580	NC_012026	CT	3	6	1186463	1186468	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3581	NC_012026	ACG	2	6	1186525	1186530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3582	NC_012026	CCT	2	6	1186546	1186551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3583	NC_012026	CTT	2	6	1186556	1186561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3584	NC_012026	TCT	2	6	1186608	1186613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3585	NC_012026	CTGC	2	8	1186648	1186655	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3586	NC_012026	CTT	2	6	1186667	1186672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3587	NC_012026	TCC	2	6	1186674	1186679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3588	NC_012026	CTT	2	6	1186694	1186699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3589	NC_012026	CCT	2	6	1186702	1186707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3590	NC_012026	TCC	2	6	1186713	1186718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3591	NC_012026	GCT	2	6	1186870	1186875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3592	NC_012026	CT	3	6	1186938	1186943	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3593	NC_012026	CTC	2	6	1187027	1187032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3594	NC_012026	TTC	2	6	1187051	1187056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3595	NC_012026	TACT	2	8	1187089	1187096	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3596	NC_012026	TGT	2	6	1187112	1187117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_012026	TTC	2	6	1187129	1187134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3598	NC_012026	TCA	2	6	1187166	1187171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3599	NC_012026	TC	3	6	1187215	1187220	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3600	NC_012026	TAC	2	6	1187263	1187268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3601	NC_012026	CTA	2	6	1187269	1187274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3602	NC_012026	CTTC	2	8	1187275	1187282	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3603	NC_012026	TAG	2	6	1187372	1187377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_012026	C	6	6	1187394	1187399	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3605	NC_012026	CTC	2	6	1187443	1187448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3606	NC_012026	C	6	6	1187468	1187473	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3607	NC_012026	CGC	2	6	1187513	1187518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3608	NC_012026	GTCC	2	8	1187706	1187713	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3609	NC_012026	CAGC	2	8	1187728	1187735	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3610	NC_012026	GTGC	2	8	1187756	1187763	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3611	NC_012026	CGTA	2	8	1189725	1189732	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3612	NC_012026	GCT	2	6	1189745	1189750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3613	NC_012026	TTGC	2	8	1189770	1189777	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3614	NC_012026	CCA	2	6	1189792	1189797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3615	NC_012026	AAC	2	6	1192136	1192141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3616	NC_012026	AGC	2	6	1192209	1192214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3617	NC_012026	ACC	2	6	1192234	1192239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3618	NC_012026	AGC	2	6	1192279	1192284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3619	NC_012026	TTA	2	6	1192791	1192796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_012026	TAA	2	6	1192803	1192808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_012026	GC	3	6	1192848	1192853	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3622	NC_012026	ACAAA	2	10	1192907	1192916	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3623	NC_012026	AGC	2	6	1193960	1193965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3624	NC_012026	GCT	2	6	1193986	1193991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3625	NC_012026	CAA	2	6	1196865	1196870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3626	NC_012026	CAC	2	6	1196907	1196912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3627	NC_012026	TGG	2	6	1196943	1196948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_012026	CAA	2	6	1197131	1197136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3629	NC_012026	ACC	2	6	1197144	1197149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3630	NC_012026	AGA	2	6	1197192	1197197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3631	NC_012026	ATT	2	6	1197323	1197328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3632	NC_012026	AGG	2	6	1198824	1198829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3633	NC_012026	TTG	2	6	1198853	1198858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3634	NC_012026	CTA	2	6	1198880	1198885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3635	NC_012026	TG	3	6	1198895	1198900	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3636	NC_012026	CAT	2	6	1199106	1199111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3637	NC_012026	GCG	2	6	1199219	1199224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3638	NC_012026	TAC	2	6	1200383	1200388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3639	NC_012026	CT	3	6	1200394	1200399	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3640	NC_012026	GCA	2	6	1201184	1201189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3641	NC_012026	TGC	2	6	1201247	1201252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3642	NC_012026	ACTTT	2	10	1201268	1201277	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3643	NC_012026	GTA	2	6	1201296	1201301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3644	NC_012026	GGT	2	6	1201329	1201334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3645	NC_012026	AAGT	2	8	1202111	1202118	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3646	NC_012026	TAC	2	6	1202154	1202159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3647	NC_012026	TTG	2	6	1202206	1202211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3648	NC_012026	ATAC	2	8	1202212	1202219	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3649	NC_012026	AC	3	6	1202218	1202223	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3650	NC_012026	GCA	2	6	1202244	1202249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3651	NC_012026	CTT	2	6	1202261	1202266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3652	NC_012026	GC	4	8	1202314	1202321	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3653	NC_012026	TTG	2	6	1202333	1202338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3654	NC_012026	TGA	2	6	1202378	1202383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3655	NC_012026	TCA	2	6	1202392	1202397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3656	NC_012026	GTT	2	6	1202407	1202412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3657	NC_012026	TGT	2	6	1202418	1202423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

< Previous12345678Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.